군은 진도개 사육농가에서 강아지를 출산했을 때 각 읍·면이나 진도개사업소에 출산신고를 하면, 출산된 강아지 구강에서 유전자를 채취, 부·모견의 유전자와 일치하였을 경우 고유번호가 저장된 전자칩을 삽입·관리하고 있다.

특히 과학적인 혈통관리로 사육 농가에서는 근친 방지와 3대 이상의 체계적인 혈통관리가 가능해졌다.

또 진도개 출생 시기부터 맞춤형 관리 시스템 도입으로 신뢰도를 확보, 진도개를 구입하는 소비자들도 좋은 반응을 보이고 있다.
 
현재 진도군에는 3,046농가가 1만1,039두의 진도개를 사육하고 있으며, 이중 5,697두가 혈통관리견으로 집중 관리되고 있다.

진도군 진도개사업소 관계자는 “오는 2017년 1월부터 고유번호가 저장된 전자칩이 삽입된 개에 대해서만 진도개 심사를 실시해 강아지 생산부터 등록까지 철저하게 관리할 예정이다”고 밝혔다.